متن پیام حجت الاسلام و المسلمین سید حسن خمینی بدین شرح است:

بسمه تعالی

درگذشت روحانی پارسا و عالم بزرگوار جناب حجت الاسلام و المسلمین آقای حاج شیخ اسحاق مشکینی موجب تأثر دوستان و علاقمندان به ایشان شد.

اینجانب درگذشت این برادر گرامی را که افتخار داشت تا فرزندی عزیز را خدمت اسلام تقدیم کند، خدمت خانواده ایشان و مردم و روحانیت بزرگوار کاشان تسلیت عرض می نمایم و از خدای متعال برای آن فقید سعید غفران واسع مسألت دارم.

سید حسن خمینی